Определение генетического редактирования системой CRISPR-Cas

Подробнее

Об услуге

Простым и быстрым способом оценки мутагенеза системой CRISPR-Cas является фрагментный анализ и секвенирование по Сэнгеру. Можно оценить варианты мутаций и долю модифицированных клеток, без проведения дорогостоящих функциональных тестов, белкового фореза, или цитометрии.

От вас потребуется:

  • Препарат ДНК или готовый ПЦР-продукт для исследуемого и контрольного образца
  • Флуоресцентно меченные праймеры для фрагментного анализа, простые праймеры для Сэнгера
  • Для анализа секвенированием по Сенгеру: сиквенс спэйсера (без PAM) и если есть – вставки с плечами гомологии (до 300 п.н.)

Результат выполненных работ:

  • Анализ мутаций системой CRISPR-Cas под ключ;
  • Отчёт;
  • Файлы;

Рекомендации для оптимального результата:

  • Рекомендуемая длина ампликона для секвенирования – 600-1000 п.н., с участком связывания gRNA примерно в середине;
  • Рекомендуемая длина ампликона для фрагментного анализа – 200-500 п.н., с участком связывания gRNA примерно в середине;
  • Фрагментный анализ предоставляет информацию о размере вставки или делеции в сайте связывания нуклеазы;
  • Секвенирование по Сэнгеру позволяет оценить структуру инделов;
  • Оба вида анализа не смогут показать вам мутации в отдельных клетках, это будет срез по популяции клеток;
  • Один из праймеров для фрагментного анализа должен быть конъюгирован с флуоресцентным красителями. Единовременно в одной лунке можно разделять фрагменты с несколькими красителями, например FAM, R6g (VIC, JOE, HEX) и TMR.
  • Образцы и праймеры можно отправлять при комнатной температуре, охлажденными или замороженными;
  • Остались вопросы? Звоните нашему консультанту +7 (966) 136-95-86

Цены и сроки выполнения работ:

Услуга Цена, руб. Срок выполнения, раб. дней
Определение мутаций, фрагментный анализ (образец и контроль) 3500 3-10
Определение мутаций, Сэнгер* (образец и контроль) 5500 3-10
Подбор праймеров, пара 1500 1-3
Синтез праймеров, за шаг (краситель оплачивается отдельно) 35 7-10
Курьер 600 1-2

Заявка на генетическое редактирование методом CRISPR-Cas

Отправляйте заявку на sequence@syngen.ru, приложите распечатанную версию к образцам.

Обратная связь:


Нажимая на кнопку, вы соглашаетесь c политикой конфиденциальности